Jan Halborg Jensen
Professor
- Udgivet
Sugar folding: A novel structural prediction tool for oligosaccharides and polysaccharides I
Xia, J., Daly, R. P., Chuang, F., Parker, L. L., Jensen, Jan Halborg & Margulis, C. J., 2007, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 3, s. 1620-1628Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sugar folding: A novel structural prediction tool for oligosaccharides and polysaccharides II
Xia, J., Daly, R. P., Chuang, F., Parker, L. L., Jensen, Jan Halborg & Margulis, C. J., 2007, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 3, s. 1629-1643Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Indium arsenide nanowire field-effect transistors for pH and biological sensing
Upadhyay, S., Frederiksen, R. S., Lloret, N. D. C., De Vico, L., Krogstrup, Peter, Jensen, Jan Halborg, Martinez, Karen Laurence & Nygård, Jesper, 2014, I: Applied Physics Letters. 104, 20, 5 s., 203504.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rationalization of the pKa values of alcohols and thiols using atomic charge descriptors and its application to the prediction of amino acid pKa's
Ugur, I., Marion, A., Parant, S., Jensen, Jan Halborg & Monard, G., 2014, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 54, 8, s. 2200-2213 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of mutations on the thermostability of Aspergillus aculeatus β-1,4-galactanase
Torpenholt, S. K., De Maria, L., Olsson, M. H. M., Christensen, L. H., Skjøt, M., Westh, P., Jensen, Jan Halborg & Lo Leggio, Leila, 2015, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 13, s. 256-264 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Improved Treatment of Ligands and Coupling Effects in Empirical Calculation and Rationalization of pKa Values
Søndergaard, C. R., Olsson, M. H. M., Rostkowski, M. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2284-2295 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Effective Fragment Molecular Orbital Method: A Merger of the Fragment Molecular Orbital and Effective Fragment Potential Methods
Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2010, I: Journal of Physical Chemistry A. 114, s. 8705-8712Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mapping enzymatic catalysis using the effective fragment molecular orbital method: towards all ab initio biochemistry
Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, 11 s., e60602.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
FragIt: a tool to prepare input files for fragment based quantum chemical calculations
Svendsen, C. S., Ibsen, M. W., Hansen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: PLoS ONE. 7, 9, 10 s., e44480.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effective fragment molecular orbital method for fragments connected by covalent bonds
Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: P L o S One. 7, 7, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Interface of the polarizable continuum model of solvation with semi-empirical methods in the GAMESS program
Svendsen, C. S., Blædel, K. L., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PloS one. 8, 7, 6 s., e67725.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic algorithm-based re-optimization of the Schrock catalyst for dinitrogen fixation
Strandgaard, Magnus, Seumer, Julius Johannes, Benediktsson, B., Bhowmik, A., Vegge, T. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: PeerJ Physical Chemistry. 5, 17 s., e30.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Using a genetic algorithm to find molecules with good docking scores
Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 15 s., e18.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational Evolution Of New Catalysts For The Morita–Baylis–Hillman Reaction
Seumer, Julius Johannes, Hansen, Jonathan Kirschner Solberg, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie. 135, 18, 8 s., e202218565.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graphical analysis of pH-dependent properties of proteins predicted using PROPKA
Rostkowski, M. P., Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: B M C Structural Biology. 11, 6Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Virtual screening of norbornadiene-based molecular solar thermal energy storage systems using a genetic algorithm
Ree, Nicolai, Koerstz, M., Mikkelsen, Kurt Valentin & Jensen, Jan Halborg, 14 nov. 2021, I: Journal of Chemical Physics. 155, 18, 7 s., 184105.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RegioSQM20: improved prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitutions
Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 1 dec. 2021, I: Journal of Cheminformatics. 13, 1, 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
What the Heck?-Automated Regioselectivity Calculations of Palladium-Catalyzed Heck Reactions Using Quantum Chemistry
Ree, Nicolai, Goeller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2 dec. 2022, I: ACS Omega. 7, 49, s. 45617–45623 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Automated quantum chemistry for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and covalent inhibitors
Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2024, I: Digital Discovery. 3, 2, s. 347-354 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RegioML: predicting the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions using machine learning
Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: Digital Discovery. 1, 2, s. 108-114 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast and automatic estimation of transition state structures using tight binding quantum chemical calculations
Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e15, 2.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toward De Novo Catalyst Discovery: Fast Identification of New Catalyst Candidates for Alcohol-Mediated Morita–Baylis–Hillman Reactions**
Rasmussen, Maria Harris, Seumer, Julius Johannes & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie - International Edition. 62, 49, 9 s., e202310580.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast and automated identification of reactions with low barriers using meta-MD simulations
Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: PeerJ Physical Chemistry. 4, 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uncertain of uncertainties? A comparison of uncertainty quantification metrics for chemical data sets
Rasmussen, Maria Harris, Duan, C., Kulik, H. J. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Journal of Cheminformatics. 15, 1, 17 s., 121.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Do machines dream of atoms? Crippen's logP as a quantitative molecular benchmark for explainable AI heatmaps
Rasmussen, Maria Harris, Christensen, D. S. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: SciPost Chemistry. 2, 1, 25 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4057
Flest downloads
-
2313
downloads
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1767
downloads
BioFET-SIM web interface: implementation and two applications
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1658
downloads
A computational method for the systematic screening of reaction barriers in enzymes: searching for Bacillus circulans xylanase mutants with greater activity towards a synthetic substrate
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet