Jan Halborg Jensen

Jan Halborg Jensen

Professor


  1. 2024
  2. Udgivet

    Automated quantum chemistry for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and covalent inhibitors

    Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2024, I: Digital Discovery. 3, 2, s. 347-354 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    Computational Evolution Of New Catalysts For The Morita–Baylis–Hillman Reaction

    Seumer, Julius Johannes, Hansen, Jonathan Kirschner Solberg, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie. 135, 18, 8 s., e202218565.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Do machines dream of atoms? Crippen's logP as a quantitative molecular benchmark for explainable AI heatmaps

    Rasmussen, Maria Harris, Christensen, D. S. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: SciPost Chemistry. 2, 1, 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Genetic algorithm-based re-optimization of the Schrock catalyst for dinitrogen fixation

    Strandgaard, Magnus, Seumer, Julius Johannes, Benediktsson, B., Bhowmik, A., Vegge, T. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: PeerJ Physical Chemistry. 5, 17 s., e30.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Toward De Novo Catalyst Discovery: Fast Identification of New Catalyst Candidates for Alcohol-Mediated Morita–Baylis–Hillman Reactions**

    Rasmussen, Maria Harris, Seumer, Julius Johannes & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie - International Edition. 62, 49, 9 s., e202310580.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Uncertain of uncertainties? A comparison of uncertainty quantification metrics for chemical data sets

    Rasmussen, Maria Harris, Duan, C., Kulik, H. J. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Journal of Cheminformatics. 15, 1, 17 s., 121.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. 2022
  10. Udgivet

    What the Heck?-Automated Regioselectivity Calculations of Palladium-Catalyzed Heck Reactions Using Quantum Chemistry

    Ree, Nicolai, Goeller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2 dec. 2022, I: ACS Omega. 7, 49, s. 45617–45623 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Substituent Control of σ-Interference Effects in the Transmission of Saturated Molecules

    Garner, M. H., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Solomon, Gemma C., 14 apr. 2022, I: ACS Physical Chemistry Au. 2, 4, s. 282-288 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    A Neural Network Approach for Property Determination of Molecular Solar Cell Candidates

    Christensen, Oliver, Schlosser, Rasmus Dalsgaard, Nielsen, R. B., Johansen, J., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Mikkelsen, Kurt Valentin, 2022, I: Journal of Physical Chemistry A. 126, 10, s. 8 1681 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Fast and automated identification of reactions with low barriers using meta-MD simulations

    Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: PeerJ Physical Chemistry. 4, 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    RegioML: predicting the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions using machine learning

    Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: Digital Discovery. 1, 2, s. 108-114 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. 2021
  16. Udgivet

    RegioSQM20: improved prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitutions

    Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 1 dec. 2021, I: Journal of Cheminformatics. 13, 1, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Virtual screening of norbornadiene-based molecular solar thermal energy storage systems using a genetic algorithm

    Ree, Nicolai, Koerstz, M., Mikkelsen, Kurt Valentin & Jensen, Jan Halborg, 14 nov. 2021, I: Journal of Chemical Physics. 155, 18, 7 s., 184105.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Fast and automated identification of reactions with low barriers: the decomposition of 3-hydroperoxypropanal

    Koerstz, M., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: SciPost Chemistry. 1, 1, 34 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    High throughput virtual screening of 230 billion molecular solar heat battery candidates

    Koerstz, M., Christensen, A. S., Mikkelsen, Kurt Valentin, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 18 s., e16.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Using a genetic algorithm to find molecules with good docking scores

    Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 15 s., e18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. 2020
  22. Udgivet

    Chemical space exploration: how genetic algorithms find the needle in the haystack

    Henault, E. S., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e11, 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Fast and automatic estimation of transition state structures using tight binding quantum chemical calculations

    Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e15, 2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2019
  25. Udgivet

    A graph-based genetic algorithm and generative model/Monte Carlo tree search for the exploration of chemical space

    Jensen, Jan Halborg, 2019, I: Chemical Science. 10, 12, s. 3567-3572

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2018
  27. Udgivet

    Improving solvation energy predictions using the SMD solvation method and semiempirical electronic structure methods

    Kromann, J. C., Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 14 sep. 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 10, 8 s., 104102 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Empirical corrections and pair interaction energies in the fragment molecular orbital method

    Fedorov, D. G., Kromann, J. C. & Jensen, Jan Halborg, 2018, I: Chemical Physics Letters. 706, s. 328-333 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Fast and accurate prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions

    Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg, Kruszyk, M., Jessing, M. & Jørgensen, M., 2018, I: Chemical Science. 9, 3, s. 660-665 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Random versus Systematic Errors in Reaction Enthalpies Computed Using Semiempirical and Minimal Basis Set Methods

    Kromann, J. C., Welford, A., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2018, I: ACS Omega. 3, 4, s. 4372-4377 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    The Bicyclo[2.2.2]octane Motif: A Class of Saturated Group 14 Quantum Interference Based Single-Molecule Insulators

    Garner, M. H., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Solomon, Gemma C., 2018, I: The Journal of Physical Chemistry Letters. 9, 24, s. 6941-6947 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  32. 2017
  33. Udgivet

    Intermolecular interactions in the condensed phase: Evaluation of semi-empirical quantum mechanical methods

    Christensen, A. S., Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg & Cui, Q., 2017, I: Journal of Chemical Physics. 147, 16, 8 s., 161704.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Prediction of pKa values for druglike molecules using semiempirical quantum chemical methods

    Jensen, Jan Halborg, Swain, C. J. & Olsen, L., 2017, I: Journal of Physical Chemistry Part A: Molecules, Spectroscopy, Kinetics, Environment and General Theory. 121, 3, s. 699-707 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Protein structure refinement using a quantum mechanics-based chemical shielding predictor

    Bratholm, L. A. & Jensen, Jan Halborg, 2017, I: Chemical Science. 8, 3, s. 2061-2072 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. 2016
  37. Udgivet

    Prediction of pKa values using the PM6 semiempirical method

    Kromann, J. C., Larsen, F., Moustafa, H. & Jensen, Jan Halborg, 2016, I: PeerJ. 4, 16 s., e2335.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Towards a barrier height benchmark set for biologically relevant systems

    Kromann, J. C., Christensen, A. S., Cui, Q. & Jensen, Jan Halborg, 2016, I: PeerJ. 4, 17 s., e1994.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. 2015
  40. Udgivet

    Bayesian inference of protein structure from chemical shift data

    Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e861.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Effect of mutations on the thermostability of Aspergillus aculeatus β-1,4-galactanase

    Torpenholt, S. K., De Maria, L., Olsson, M. H. M., Christensen, L. H., Skjøt, M., Westh, P., Jensen, Jan Halborg & Lo Leggio, Leila, 2015, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 13, s. 256-264 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Predicting accurate absolute binding energies in aqueous solution: thermodynamic considerations for electronic structure methods

    Jensen, Jan Halborg, 2015, I: Physical chemistry chemical physics : PCCP. 17, 19, s. 12441-12451 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    ProCS15: a DFT-based chemical shift predictor for backbone and Cβatoms in proteins

    Larsen, A. S., Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Channir, M. & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e1344.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. 2014
  45. Udgivet

    In Silico prediction of mutant HIV-1 proteases cleaving a target sequence

    Jensen, Jan Halborg, Willemoës, Martin, Winther, Jakob R. & De Vico, L., 2014, I: P L o S One. 9, 5, 11 s., 5.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    A third-generation dispersion and third-generation hydrogen bonding corrected PM6 method: PM6-D3H+

    Kromann, J. C., Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Korth, M. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, s. e449

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    FragBuilder: an efficient Python library to setup quantum chemistry calculations on peptides models

    Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, e277.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Hybrid RHF/MP2 geometry optimizations with the effective fragment molecular orbital method

    Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PloS one. 9, 2, 6 s., e88800.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Indium arsenide nanowire field-effect transistors for pH and biological sensing

    Upadhyay, S., Frederiksen, R. S., Lloret, N. D. C., De Vico, L., Krogstrup, Peter, Jensen, Jan Halborg, Martinez, Karen Laurence & Nygård, Jesper, 2014, I: Applied Physics Letters. 104, 20, 5 s., 203504.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Rationalization of the pKa values of alcohols and thiols using atomic charge descriptors and its application to the prediction of amino acid pKa's

    Ugur, I., Marion, A., Parant, S., Jensen, Jan Halborg & Monard, G., 2014, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 54, 8, s. 2200-2213 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. 2013
  52. Udgivet

    In silico screening of 393 mutants facilitates enzyme engineering of amidase activity in CalB

    Hediger, M. R., De Vico, L., Rannes, J. B., Jäckel, C., Besenmatter, W., Svendsen, A. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PeerJ. 1, 15 s., e145.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    A computational method for the systematic screening of reaction barriers in enzymes: searching for Bacillus circulans xylanase mutants with greater activity towards a synthetic substrate

    Hediger, M. R., Svendsen, C. S., De Vico, L. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PeerJ. 1, 19 s., e111.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    BioFET-SIM: a tool for the analysis and prediction of signal changes in nanowire-based field effect transistor biosensors

    Hediger, M. R., Martinez, Karen Laurence, Nygård, Jesper, Brandbyge, M., Jensen, Jan Halborg & De Vico, L., 2013, Nanoscale sensors. 978-3-319-02771-5: Springer, s. 55-86 32 s. (Lecture Notes in Nanoscale Science and Technology, Bind 15).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Effects of buffer composition and dilution on nanowire field-effect biosensors

    Lloret, N. D. C., Frederiksen, R. S., Møller, T. C., Rieben, N. I., Upadhyay, S., De Vico, L., Jensen, Jan Halborg, Nygård, Jesper & Martinez, Karen Laurence, 2013, I: Nanotechnology. 24, 3, 035501.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Fully integrated effective fragment molecular orbital method

    Pruitt, S. R., Svendsen, C. S., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 5, s. 2235-2249 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Interface of the polarizable continuum model of solvation with semi-empirical methods in the GAMESS program

    Svendsen, C. S., Blædel, K. L., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PloS one. 8, 7, 6 s., e67725.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Mapping enzymatic catalysis using the effective fragment molecular orbital method: towards all ab initio biochemistry

    Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, 11 s., e60602.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

    Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  60. Udgivet

    Predicting pKa for proteins using COSMO-RS

    Andersson, M. P., Jensen, Jan Halborg & Stipp, S. L. S., 2013, I: PeerJ. 1, 7 s., e198.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics

    Christensen, A. S., Linnet, T. E., Borg, M., Boomsma, Wouter, Lindorff-Larsen, Kresten, Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLoS ONE. 8, 12, 10 s., e84123.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  62. Udgivet

    The molecule calculator: a web application for fast quantum mechanics-based estimation of molecular properties

    Jensen, Jan Halborg & Kromann, J. C., 2013, I: Journal of Chemical Education. 90, 8, s. 1093-1095 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 4057