Jan Halborg Jensen

Jan Halborg Jensen

Professor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0002-1465-1010

    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 80 ud af 80Pr. side: 500
    Sortering: Udgivelsesdato
    1. 2024
    2. Udgivet

      Automated quantum chemistry for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and covalent inhibitors

      Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2024, I: Digital Discovery. 3, 2, s. 347-354 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. 2023
    4. Udgivet

      Computational Evolution Of New Catalysts For The Morita–Baylis–Hillman Reaction

      Seumer, Julius Johannes, Hansen, Jonathan Kirschner Solberg, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie. 135, 18, 8 s., e202218565.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      Do machines dream of atoms? Crippen's logP as a quantitative molecular benchmark for explainable AI heatmaps

      Rasmussen, Maria Harris, Christensen, D. S. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: SciPost Chemistry. 2, 1, 25 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      Genetic algorithm-based re-optimization of the Schrock catalyst for dinitrogen fixation

      Strandgaard, Magnus, Seumer, Julius Johannes, Benediktsson, B., Bhowmik, A., Vegge, T. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: PeerJ Physical Chemistry. 5, 17 s., e30.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      Toward De Novo Catalyst Discovery: Fast Identification of New Catalyst Candidates for Alcohol-Mediated Morita–Baylis–Hillman Reactions**

      Rasmussen, Maria Harris, Seumer, Julius Johannes & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie - International Edition. 62, 49, 9 s., e202310580.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      Uncertain of uncertainties? A comparison of uncertainty quantification metrics for chemical data sets

      Rasmussen, Maria Harris, Duan, C., Kulik, H. J. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Journal of Cheminformatics. 15, 1, 17 s., 121.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. 2022
    10. Udgivet

      What the Heck?-Automated Regioselectivity Calculations of Palladium-Catalyzed Heck Reactions Using Quantum Chemistry

      Ree, Nicolai, Goeller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2 dec. 2022, I: ACS Omega. 7, 49, s. 45617–45623 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      Substituent Control of σ-Interference Effects in the Transmission of Saturated Molecules

      Garner, M. H., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Solomon, Gemma C., 14 apr. 2022, I: ACS Physical Chemistry Au. 2, 4, s. 282-288 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. Udgivet

      A Neural Network Approach for Property Determination of Molecular Solar Cell Candidates

      Christensen, Oliver, Schlosser, Rasmus Dalsgaard, Nielsen, R. B., Johansen, J., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Mikkelsen, Kurt Valentin, 2022, I: Journal of Physical Chemistry A. 126, 10, s. 8 1681 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      Fast and automated identification of reactions with low barriers using meta-MD simulations

      Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: PeerJ Physical Chemistry. 4, 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      RegioML: predicting the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions using machine learning

      Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: Digital Discovery. 1, 2, s. 108-114 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    15. 2021
    16. Udgivet

      RegioSQM20: improved prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitutions

      Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 1 dec. 2021, I: Journal of Cheminformatics. 13, 1, 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      Virtual screening of norbornadiene-based molecular solar thermal energy storage systems using a genetic algorithm

      Ree, Nicolai, Koerstz, M., Mikkelsen, Kurt Valentin & Jensen, Jan Halborg, 14 nov. 2021, I: Journal of Chemical Physics. 155, 18, 7 s., 184105.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      Fast and automated identification of reactions with low barriers: the decomposition of 3-hydroperoxypropanal

      Koerstz, M., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: SciPost Chemistry. 1, 1, 34 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      High throughput virtual screening of 230 billion molecular solar heat battery candidates

      Koerstz, M., Christensen, A. S., Mikkelsen, Kurt Valentin, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 18 s., e16.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Udgivet

      Using a genetic algorithm to find molecules with good docking scores

      Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 15 s., e18.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. 2020
    22. Udgivet

      Chemical space exploration: how genetic algorithms find the needle in the haystack

      Henault, E. S., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e11, 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      Fast and automatic estimation of transition state structures using tight binding quantum chemical calculations

      Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e15, 2.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. 2019
    25. Udgivet

      A graph-based genetic algorithm and generative model/Monte Carlo tree search for the exploration of chemical space

      Jensen, Jan Halborg, 2019, I: Chemical Science. 10, 12, s. 3567-3572

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. 2018
    27. Udgivet

      Improving solvation energy predictions using the SMD solvation method and semiempirical electronic structure methods

      Kromann, J. C., Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 14 sep. 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 10, 8 s., 104102 .

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    28. Udgivet

      Empirical corrections and pair interaction energies in the fragment molecular orbital method

      Fedorov, D. G., Kromann, J. C. & Jensen, Jan Halborg, 2018, I: Chemical Physics Letters. 706, s. 328-333 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    29. Udgivet

      Fast and accurate prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions

      Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg, Kruszyk, M., Jessing, M. & Jørgensen, M., 2018, I: Chemical Science. 9, 3, s. 660-665 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    30. Udgivet

      Random versus Systematic Errors in Reaction Enthalpies Computed Using Semiempirical and Minimal Basis Set Methods

      Kromann, J. C., Welford, A., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2018, I: ACS Omega. 3, 4, s. 4372-4377 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. Udgivet

      The Bicyclo[2.2.2]octane Motif: A Class of Saturated Group 14 Quantum Interference Based Single-Molecule Insulators

      Garner, M. H., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Solomon, Gemma C., 2018, I: The Journal of Physical Chemistry Letters. 9, 24, s. 6941-6947 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

    32. 2017
    33. Udgivet

      Intermolecular interactions in the condensed phase: Evaluation of semi-empirical quantum mechanical methods

      Christensen, A. S., Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg & Cui, Q., 2017, I: Journal of Chemical Physics. 147, 16, 8 s., 161704.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    34. Udgivet

      Prediction of pKa values for druglike molecules using semiempirical quantum chemical methods

      Jensen, Jan Halborg, Swain, C. J. & Olsen, L., 2017, I: Journal of Physical Chemistry Part A: Molecules, Spectroscopy, Kinetics, Environment and General Theory. 121, 3, s. 699-707 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    35. Udgivet

      Protein structure refinement using a quantum mechanics-based chemical shielding predictor

      Bratholm, L. A. & Jensen, Jan Halborg, 2017, I: Chemical Science. 8, 3, s. 2061-2072 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    36. 2016
    37. Udgivet

      Prediction of pKa values using the PM6 semiempirical method

      Kromann, J. C., Larsen, F., Moustafa, H. & Jensen, Jan Halborg, 2016, I: PeerJ. 4, 16 s., e2335.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. Udgivet

      Towards a barrier height benchmark set for biologically relevant systems

      Kromann, J. C., Christensen, A. S., Cui, Q. & Jensen, Jan Halborg, 2016, I: PeerJ. 4, 17 s., e1994.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. 2015
    40. Udgivet

      Bayesian inference of protein structure from chemical shift data

      Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e861.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    41. Udgivet

      Effect of mutations on the thermostability of Aspergillus aculeatus β-1,4-galactanase

      Torpenholt, S. K., De Maria, L., Olsson, M. H. M., Christensen, L. H., Skjøt, M., Westh, P., Jensen, Jan Halborg & Lo Leggio, Leila, 2015, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 13, s. 256-264 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    42. Udgivet

      Predicting accurate absolute binding energies in aqueous solution: thermodynamic considerations for electronic structure methods

      Jensen, Jan Halborg, 2015, I: Physical chemistry chemical physics : PCCP. 17, 19, s. 12441-12451 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    43. Udgivet

      ProCS15: a DFT-based chemical shift predictor for backbone and Cβatoms in proteins

      Larsen, A. S., Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Channir, M. & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e1344.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    44. 2014
    45. Udgivet

      In Silico prediction of mutant HIV-1 proteases cleaving a target sequence

      Jensen, Jan Halborg, Willemoës, Martin, Winther, Jakob R. & De Vico, L., 2014, I: P L o S One. 9, 5, 11 s., 5.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    46. Udgivet

      A third-generation dispersion and third-generation hydrogen bonding corrected PM6 method: PM6-D3H+

      Kromann, J. C., Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Korth, M. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, s. e449

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. Udgivet

      FragBuilder: an efficient Python library to setup quantum chemistry calculations on peptides models

      Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, e277.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    48. Udgivet

      Hybrid RHF/MP2 geometry optimizations with the effective fragment molecular orbital method

      Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PloS one. 9, 2, 6 s., e88800.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    49. Udgivet

      Indium arsenide nanowire field-effect transistors for pH and biological sensing

      Upadhyay, S., Frederiksen, R. S., Lloret, N. D. C., De Vico, L., Krogstrup, Peter, Jensen, Jan Halborg, Martinez, Karen Laurence & Nygård, Jesper, 2014, I: Applied Physics Letters. 104, 20, 5 s., 203504.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. Udgivet

      Rationalization of the pKa values of alcohols and thiols using atomic charge descriptors and its application to the prediction of amino acid pKa's

      Ugur, I., Marion, A., Parant, S., Jensen, Jan Halborg & Monard, G., 2014, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 54, 8, s. 2200-2213 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    51. 2013
    52. Udgivet

      In silico screening of 393 mutants facilitates enzyme engineering of amidase activity in CalB

      Hediger, M. R., De Vico, L., Rannes, J. B., Jäckel, C., Besenmatter, W., Svendsen, A. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PeerJ. 1, 15 s., e145.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    53. Udgivet

      A computational method for the systematic screening of reaction barriers in enzymes: searching for Bacillus circulans xylanase mutants with greater activity towards a synthetic substrate

      Hediger, M. R., Svendsen, C. S., De Vico, L. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PeerJ. 1, 19 s., e111.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    54. Udgivet

      BioFET-SIM: a tool for the analysis and prediction of signal changes in nanowire-based field effect transistor biosensors

      Hediger, M. R., Martinez, Karen Laurence, Nygård, Jesper, Brandbyge, M., Jensen, Jan Halborg & De Vico, L., 2013, Nanoscale sensors. 978-3-319-02771-5: Springer, s. 55-86 32 s. (Lecture Notes in Nanoscale Science and Technology, Bind 15).

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

    55. Udgivet

      Effects of buffer composition and dilution on nanowire field-effect biosensors

      Lloret, N. D. C., Frederiksen, R. S., Møller, T. C., Rieben, N. I., Upadhyay, S., De Vico, L., Jensen, Jan Halborg, Nygård, Jesper & Martinez, Karen Laurence, 2013, I: Nanotechnology. 24, 3, 035501.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    56. Udgivet

      Fully integrated effective fragment molecular orbital method

      Pruitt, S. R., Svendsen, C. S., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 5, s. 2235-2249 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    57. Udgivet

      Interface of the polarizable continuum model of solvation with semi-empirical methods in the GAMESS program

      Svendsen, C. S., Blædel, K. L., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PloS one. 8, 7, 6 s., e67725.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    58. Udgivet

      Mapping enzymatic catalysis using the effective fragment molecular orbital method: towards all ab initio biochemistry

      Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, 11 s., e60602.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    59. Udgivet

      PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

      Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    60. Udgivet

      Predicting pKa for proteins using COSMO-RS

      Andersson, M. P., Jensen, Jan Halborg & Stipp, S. L. S., 2013, I: PeerJ. 1, 7 s., e198.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    61. Udgivet

      Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics

      Christensen, A. S., Linnet, T. E., Borg, M., Boomsma, Wouter, Lindorff-Larsen, Kresten, Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLoS ONE. 8, 12, 10 s., e84123.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    62. Udgivet

      The molecule calculator: a web application for fast quantum mechanics-based estimation of molecular properties

      Jensen, Jan Halborg & Kromann, J. C., 2013, I: Journal of Chemical Education. 90, 8, s. 1093-1095 3 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    63. 2012
    64. Udgivet

      A computational methodology to screen activities of enzyme variants

      Hediger, M. R., De Vico, L., Svendsen, A., Besenmatter, W. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: P L o S One. 7, 12, 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    65. Udgivet

      BioFET-SIM web interface: implementation and two applications

      Hediger, M. R., Jensen, Jan Halborg & De Vico, L., 2012, I: P L o S One. 7, 10, 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    66. Udgivet

      FragIt: a tool to prepare input files for fragment based quantum chemical calculations

      Svendsen, C. S., Ibsen, M. W., Hansen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: PLoS ONE. 7, 9, 10 s., e44480.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    67. Udgivet

      The effective fragment molecular orbital method for fragments connected by covalent bonds

      Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: P L o S One. 7, 7, 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    68. 2011
    69. Udgivet

      Definitive Benchmark Study of Ring Current Effects on Amide Proton Chemical Shifts

      Christensen, A. S., Sauer, Stephan P. A. & Jensen, Jan Halborg, 1 jun. 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2078 2084 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    70. Udgivet

      Graphical analysis of pH-dependent properties of proteins predicted using PROPKA

      Rostkowski, M. P., Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: B M C Structural Biology. 11, 6

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    71. Udgivet

      Improved Treatment of Ligands and Coupling Effects in Empirical Calculation and Rationalization of pKa Values

      Søndergaard, C. R., Olsson, M. H. M., Rostkowski, M. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2284-2295 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    72. Udgivet

      PROPKA3: Consistent Treatment of Internal and Surface Residues in Empirical pKa Predictions

      Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R., Rostkowski, M. P. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 2, s. 525-537

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    73. Udgivet

      Predicting and rationalizing the effect of surface charge distribution and orientation on nanowire based bioFET sensors

      De Vico, L., Iversen, L., Sørensen, M. H., Brandbyge, M., Nygård, Jesper, Martinez, Karen Laurence & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Nanoscale. 3, 9, s. 3635-3640 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    74. Udgivet

      Quantifying signal changes in nano-wire based biosensors

      De Vico, L., Sørensen, M. H., Iversen, L., Rogers, D. M., Sørensen, B. S., Brandbyge, M., Nygård, Jesper, Martinez, Karen Laurence & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Nanoscale. 3, s. 706-717 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    75. 2010
    76. Udgivet

      Energy Gradients in Combined Fragment Molecular Orbital and Polarizable Continuum Model (FMO/PCM) Calculation

      Li, H., Fedorov, D. G., Nagata, T., Kitaura, K., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2010, I: Journal of Computational Chemistry. 32, s. 778-790

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    77. Udgivet

      Exchange repulsion between effective fragment potentials and ab initio molecules

      Kemp, D. D., Rintelman, J. M., Gordon, M. S. & Jensen, Jan Halborg, 2010, I: Theoretical Chemistry Accounts. 125, s. 481–491

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    78. Udgivet

      Molecular modeling basics

      Jensen, Jan Halborg, 2010, CRC Press. 175 s.

      Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt

    79. Udgivet

      The Effective Fragment Molecular Orbital Method: A Merger of the Fragment Molecular Orbital and Effective Fragment Potential Methods

      Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2010, I: Journal of Physical Chemistry A. 114, s. 8705-8712

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    80. 2009
    81. Udgivet

      Analytic gradient for the adaptive frozen orbital bond detachment in the fragment molecular orbital method

      Fedorov, D. G., Avramov, P. V., Jensen, Jan Halborg & Kitaura, K., 2009, I: Chemical Physics Letters. 477, 1-3, s. 169-175 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    82. Udgivet

      Calculations of Reduction Potentials and pKa Values

      Li, H. & Jensen, Jan Halborg, 2009, Computational Inorganic and Bioinorganic Chemistry. Solomon, E. I., Scott, R. A. & King, R. B. (red.). Wiley, s. 109-122 14 s.

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

    83. 2008
    84. Udgivet

      Calculating pH and salt dependence of protein-protein binding

      Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Current Pharmaceutical Biotechnology. 9, s. 96-102

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    85. Udgivet

      Covalent bond fragmentation suitable to describe surfaces in the fragment molecular orbital method

      Fedorov, D. G., Deka, R. C., Kitaura, K. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Journal of Physical Chemistry A. 112, s. 11808–11816

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    86. Udgivet

      Protein – Protein Binding is Often Associated With Changes in Protonation State

      Mason, A. C. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Proteins - Structure Function and Bioinformatics. 71, 1, s. 81-91

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    87. Udgivet

      Rationalization of the Difference in Lifetime of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates in Trypanosoma rangeli Sialidase

      Parker, L. L., Chung, Y., Margulis, C. J. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Journal of Physical Chemistry B. 112, s. 14093-14095

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    88. Udgivet

      Role of the virtual orbitals and HOMO-LUMO gap in mean-field approximations to the conductance of molecular junctions

      Cehovin, A., Mera Couto, H., Jensen, Jan Halborg, Stokbro, K. & Pedersen, T. B., 2008, I: Physical Review B Condensed Matter. 77, 19

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    89. Udgivet

      Short strong hydrogen bonds in proteins: a case study of rhamnogalacturonan acetylesterase

      Langkilde, Annette Eva, Kristensen, S. M., Lo Leggio, Leila, Mølgaard, A., Jensen, Jan Halborg, Houk, A. R., Poulsen, Jens-Christian Navarro, Larsen, Sine & Kauppinen, S., 2008, I: Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography. 64, s. 851-863

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    90. Udgivet

      Very Fast Prediction and Rationalization of pKa Values for Protein-Ligand Complexes

      Bas, D. C., Rogers, D. M. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Proteins - Structure Function and Bioinformatics. 73, s. 765-783

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    91. 2007
    92. Udgivet

      FTIR Spectroscopy Combined with Quantum Chemical Calculations to Investigate Adsorbed Nitrate on Aluminum Oxide Surfaces in the Presence and Absence of Co-Adsorbed Water

      Baltrusaitis, J., Schuttlefield, J. D., Jensen, Jan Halborg & Grassian, V. H., 2007, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 9, s. 4970-4981

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    93. Udgivet

      PDB2PQR: Expanding and upgrading automated preparation of biomolecular structures for molecular simulations

      Dolinsky, T. J., Czodrowski, P., Li, H., Jensen, Jan Halborg, Nielsen, J., Klebe, G. & Baker, N. A., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, s. W522-W525

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    94. Udgivet

      Prediction and rationalization of the pH-dependence of activity and stability of family 11 xylanases

      Kongsted, J., Ryde, U., Wydra, J. & Jensen, Jan Halborg, 2007, I: Biochemistry. 46, s. 13581-13592

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    95. Udgivet

      Sugar folding: A novel structural prediction tool for oligosaccharides and polysaccharides I

      Xia, J., Daly, R. P., Chuang, F., Parker, L. L., Jensen, Jan Halborg & Margulis, C. J., 2007, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 3, s. 1620-1628

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    96. Udgivet

      Sugar folding: A novel structural prediction tool for oligosaccharides and polysaccharides II

      Xia, J., Daly, R. P., Chuang, F., Parker, L. L., Jensen, Jan Halborg & Margulis, C. J., 2007, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 3, s. 1629-1643

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    97. Udgivet

      Surface Reactions of Carbon Dioxide at the Adsorbed Water – Oxide Interface

      Baltrusaitis, J., Schuttlefield, J. D., Zeitler, E., Jensen, Jan Halborg & Grassian, V. H., 2007, I: Journal of Physical Chemistry C. 111, s. 14870-14880

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    98. Udgivet

      The effective fragment potential: a general method for predicting intermolecular interactions

      Gordon, M. S., Slipchenko, L., Li, H. & Jensen, Jan Halborg, 2007, Annual Reports in Computational Chemistry. Spellmeyer, D. C. & Wheeler, R. A. (red.). Elsevier, Bind 3. s. 177-193

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

    ID: 4057