Jan Halborg Jensen

Jan Halborg Jensen

Professor


  1. Udgivet

    Effects of buffer composition and dilution on nanowire field-effect biosensors

    Lloret, N. D. C., Frederiksen, R. S., Møller, T. C., Rieben, N. I., Upadhyay, S., De Vico, L., Jensen, Jan Halborg, Nygård, Jesper & Martinez, Karen Laurence, 2013, I: Nanotechnology. 24, 3, 035501.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Protein – Protein Binding is Often Associated With Changes in Protonation State

    Mason, A. C. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Proteins - Structure Function and Bioinformatics. 71, 1, s. 81-91

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    PROPKA3: Consistent Treatment of Internal and Surface Residues in Empirical pKa Predictions

    Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R., Rostkowski, M. P. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 2, s. 525-537

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Rationalization of the Difference in Lifetime of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates in Trypanosoma rangeli Sialidase

    Parker, L. L., Chung, Y., Margulis, C. J. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Journal of Physical Chemistry B. 112, s. 14093-14095

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Fully integrated effective fragment molecular orbital method

    Pruitt, S. R., Svendsen, C. S., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 5, s. 2235-2249 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Toward De Novo Catalyst Discovery: Fast Identification of New Catalyst Candidates for Alcohol-Mediated Morita–Baylis–Hillman Reactions**

    Rasmussen, Maria Harris, Seumer, Julius Johannes & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie - International Edition. 62, 49, 9 s., e202310580.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Fast and automated identification of reactions with low barriers using meta-MD simulations

    Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: PeerJ Physical Chemistry. 4, 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Uncertain of uncertainties? A comparison of uncertainty quantification metrics for chemical data sets

    Rasmussen, Maria Harris, Duan, C., Kulik, H. J. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Journal of Cheminformatics. 15, 1, 17 s., 121.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Do machines dream of atoms? Crippen's logP as a quantitative molecular benchmark for explainable AI heatmaps

    Rasmussen, Maria Harris, Christensen, D. S. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: SciPost Chemistry. 2, 1, 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Fast and automatic estimation of transition state structures using tight binding quantum chemical calculations

    Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e15, 2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Virtual screening of norbornadiene-based molecular solar thermal energy storage systems using a genetic algorithm

    Ree, Nicolai, Koerstz, M., Mikkelsen, Kurt Valentin & Jensen, Jan Halborg, 14 nov. 2021, I: Journal of Chemical Physics. 155, 18, 7 s., 184105.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    RegioSQM20: improved prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitutions

    Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 1 dec. 2021, I: Journal of Cheminformatics. 13, 1, 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    What the Heck?-Automated Regioselectivity Calculations of Palladium-Catalyzed Heck Reactions Using Quantum Chemistry

    Ree, Nicolai, Goeller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2 dec. 2022, I: ACS Omega. 7, 49, s. 45617–45623 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Automated quantum chemistry for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and covalent inhibitors

    Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2024, I: Digital Discovery. 3, 2, s. 347-354 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    RegioML: predicting the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions using machine learning

    Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: Digital Discovery. 1, 2, s. 108-114 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Graphical analysis of pH-dependent properties of proteins predicted using PROPKA

    Rostkowski, M. P., Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: B M C Structural Biology. 11, 6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Computational Evolution Of New Catalysts For The Morita–Baylis–Hillman Reaction

    Seumer, Julius Johannes, Hansen, Jonathan Kirschner Solberg, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie. 135, 18, 8 s., e202218565.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Using a genetic algorithm to find molecules with good docking scores

    Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 15 s., e18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Genetic algorithm-based re-optimization of the Schrock catalyst for dinitrogen fixation

    Strandgaard, Magnus, Seumer, Julius Johannes, Benediktsson, B., Bhowmik, A., Vegge, T. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: PeerJ Physical Chemistry. 5, 17 s., e30.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    The Effective Fragment Molecular Orbital Method: A Merger of the Fragment Molecular Orbital and Effective Fragment Potential Methods

    Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2010, I: Journal of Physical Chemistry A. 114, s. 8705-8712

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Mapping enzymatic catalysis using the effective fragment molecular orbital method: towards all ab initio biochemistry

    Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, 11 s., e60602.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    FragIt: a tool to prepare input files for fragment based quantum chemical calculations

    Svendsen, C. S., Ibsen, M. W., Hansen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: PLoS ONE. 7, 9, 10 s., e44480.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Interface of the polarizable continuum model of solvation with semi-empirical methods in the GAMESS program

    Svendsen, C. S., Blædel, K. L., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PloS one. 8, 7, 6 s., e67725.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    The effective fragment molecular orbital method for fragments connected by covalent bonds

    Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: P L o S One. 7, 7, 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Improved Treatment of Ligands and Coupling Effects in Empirical Calculation and Rationalization of pKa Values

    Søndergaard, C. R., Olsson, M. H. M., Rostkowski, M. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2284-2295 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4057