Jan Halborg Jensen

Jan Halborg Jensen

Professor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0002-1465-1010

    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 50 ud af 80Pr. side: 50
    Sortering: Titel
    1. Udgivet

      In Silico prediction of mutant HIV-1 proteases cleaving a target sequence

      Jensen, Jan Halborg, Willemoës, Martin, Winther, Jakob R. & De Vico, L., 2014, I: P L o S One. 9, 5, 11 s., 5.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    2. Udgivet

      In silico screening of 393 mutants facilitates enzyme engineering of amidase activity in CalB

      Hediger, M. R., De Vico, L., Rannes, J. B., Jäckel, C., Besenmatter, W., Svendsen, A. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PeerJ. 1, 15 s., e145.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. Udgivet

      A Neural Network Approach for Property Determination of Molecular Solar Cell Candidates

      Christensen, Oliver, Schlosser, Rasmus Dalsgaard, Nielsen, R. B., Johansen, J., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Mikkelsen, Kurt Valentin, 2022, I: Journal of Physical Chemistry A. 126, 10, s. 8 1681 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    4. Udgivet

      A computational method for the systematic screening of reaction barriers in enzymes: searching for Bacillus circulans xylanase mutants with greater activity towards a synthetic substrate

      Hediger, M. R., Svendsen, C. S., De Vico, L. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PeerJ. 1, 19 s., e111.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      A computational methodology to screen activities of enzyme variants

      Hediger, M. R., De Vico, L., Svendsen, A., Besenmatter, W. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: P L o S One. 7, 12, 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      A graph-based genetic algorithm and generative model/Monte Carlo tree search for the exploration of chemical space

      Jensen, Jan Halborg, 2019, I: Chemical Science. 10, 12, s. 3567-3572

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      A third-generation dispersion and third-generation hydrogen bonding corrected PM6 method: PM6-D3H+

      Kromann, J. C., Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Korth, M. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, s. e449

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      Analytic gradient for the adaptive frozen orbital bond detachment in the fragment molecular orbital method

      Fedorov, D. G., Avramov, P. V., Jensen, Jan Halborg & Kitaura, K., 2009, I: Chemical Physics Letters. 477, 1-3, s. 169-175 7 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      Automated quantum chemistry for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and covalent inhibitors

      Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2024, I: Digital Discovery. 3, 2, s. 347-354 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Bayesian inference of protein structure from chemical shift data

      Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e861.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      BioFET-SIM: a tool for the analysis and prediction of signal changes in nanowire-based field effect transistor biosensors

      Hediger, M. R., Martinez, Karen Laurence, Nygård, Jesper, Brandbyge, M., Jensen, Jan Halborg & De Vico, L., 2013, Nanoscale sensors. 978-3-319-02771-5: Springer, s. 55-86 32 s. (Lecture Notes in Nanoscale Science and Technology, Bind 15).

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

    12. Udgivet

      BioFET-SIM web interface: implementation and two applications

      Hediger, M. R., Jensen, Jan Halborg & De Vico, L., 2012, I: P L o S One. 7, 10, 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      Calculating pH and salt dependence of protein-protein binding

      Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Current Pharmaceutical Biotechnology. 9, s. 96-102

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      Calculations of Reduction Potentials and pKa Values

      Li, H. & Jensen, Jan Halborg, 2009, Computational Inorganic and Bioinorganic Chemistry. Solomon, E. I., Scott, R. A. & King, R. B. (red.). Wiley, s. 109-122 14 s.

      Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning

    15. Udgivet

      Chemical space exploration: how genetic algorithms find the needle in the haystack

      Henault, E. S., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e11, 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    16. Udgivet

      Computational Evolution Of New Catalysts For The Morita–Baylis–Hillman Reaction

      Seumer, Julius Johannes, Hansen, Jonathan Kirschner Solberg, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie. 135, 18, 8 s., e202218565.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      Covalent bond fragmentation suitable to describe surfaces in the fragment molecular orbital method

      Fedorov, D. G., Deka, R. C., Kitaura, K. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Journal of Physical Chemistry A. 112, s. 11808–11816

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      Definitive Benchmark Study of Ring Current Effects on Amide Proton Chemical Shifts

      Christensen, A. S., Sauer, Stephan P. A. & Jensen, Jan Halborg, 1 jun. 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2078 2084 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      Do machines dream of atoms? Crippen's logP as a quantitative molecular benchmark for explainable AI heatmaps

      Rasmussen, Maria Harris, Christensen, D. S. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: SciPost Chemistry. 2, 1, 25 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Udgivet

      Effect of mutations on the thermostability of Aspergillus aculeatus β-1,4-galactanase

      Torpenholt, S. K., De Maria, L., Olsson, M. H. M., Christensen, L. H., Skjøt, M., Westh, P., Jensen, Jan Halborg & Lo Leggio, Leila, 2015, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 13, s. 256-264 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. Udgivet

      Effects of buffer composition and dilution on nanowire field-effect biosensors

      Lloret, N. D. C., Frederiksen, R. S., Møller, T. C., Rieben, N. I., Upadhyay, S., De Vico, L., Jensen, Jan Halborg, Nygård, Jesper & Martinez, Karen Laurence, 2013, I: Nanotechnology. 24, 3, 035501.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Empirical corrections and pair interaction energies in the fragment molecular orbital method

      Fedorov, D. G., Kromann, J. C. & Jensen, Jan Halborg, 2018, I: Chemical Physics Letters. 706, s. 328-333 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      Energy Gradients in Combined Fragment Molecular Orbital and Polarizable Continuum Model (FMO/PCM) Calculation

      Li, H., Fedorov, D. G., Nagata, T., Kitaura, K., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2010, I: Journal of Computational Chemistry. 32, s. 778-790

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. Udgivet

      Exchange repulsion between effective fragment potentials and ab initio molecules

      Kemp, D. D., Rintelman, J. M., Gordon, M. S. & Jensen, Jan Halborg, 2010, I: Theoretical Chemistry Accounts. 125, s. 481–491

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    25. Udgivet

      FTIR Spectroscopy Combined with Quantum Chemical Calculations to Investigate Adsorbed Nitrate on Aluminum Oxide Surfaces in the Presence and Absence of Co-Adsorbed Water

      Baltrusaitis, J., Schuttlefield, J. D., Jensen, Jan Halborg & Grassian, V. H., 2007, I: Physical Chemistry Chemical Physics. 9, s. 4970-4981

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. Udgivet

      Fast and accurate prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions

      Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg, Kruszyk, M., Jessing, M. & Jørgensen, M., 2018, I: Chemical Science. 9, 3, s. 660-665 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    27. Udgivet

      Fast and automated identification of reactions with low barriers using meta-MD simulations

      Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: PeerJ Physical Chemistry. 4, 17 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    28. Udgivet

      Fast and automated identification of reactions with low barriers: the decomposition of 3-hydroperoxypropanal

      Koerstz, M., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: SciPost Chemistry. 1, 1, 34 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    29. Udgivet

      Fast and automatic estimation of transition state structures using tight binding quantum chemical calculations

      Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e15, 2.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    30. Udgivet

      FragBuilder: an efficient Python library to setup quantum chemistry calculations on peptides models

      Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, e277.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. Udgivet

      FragIt: a tool to prepare input files for fragment based quantum chemical calculations

      Svendsen, C. S., Ibsen, M. W., Hansen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: PLoS ONE. 7, 9, 10 s., e44480.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    32. Udgivet

      Fully integrated effective fragment molecular orbital method

      Pruitt, S. R., Svendsen, C. S., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 5, s. 2235-2249 15 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    33. Udgivet

      Genetic algorithm-based re-optimization of the Schrock catalyst for dinitrogen fixation

      Strandgaard, Magnus, Seumer, Julius Johannes, Benediktsson, B., Bhowmik, A., Vegge, T. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: PeerJ Physical Chemistry. 5, 17 s., e30.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    34. Udgivet

      Graphical analysis of pH-dependent properties of proteins predicted using PROPKA

      Rostkowski, M. P., Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: B M C Structural Biology. 11, 6

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    35. Udgivet

      High throughput virtual screening of 230 billion molecular solar heat battery candidates

      Koerstz, M., Christensen, A. S., Mikkelsen, Kurt Valentin, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 18 s., e16.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    36. Udgivet

      Hybrid RHF/MP2 geometry optimizations with the effective fragment molecular orbital method

      Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PloS one. 9, 2, 6 s., e88800.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    37. Udgivet

      Improved Treatment of Ligands and Coupling Effects in Empirical Calculation and Rationalization of pKa Values

      Søndergaard, C. R., Olsson, M. H. M., Rostkowski, M. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2284-2295 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. Udgivet

      Improving solvation energy predictions using the SMD solvation method and semiempirical electronic structure methods

      Kromann, J. C., Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 14 sep. 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 10, 8 s., 104102 .

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. Udgivet

      Indium arsenide nanowire field-effect transistors for pH and biological sensing

      Upadhyay, S., Frederiksen, R. S., Lloret, N. D. C., De Vico, L., Krogstrup, Peter, Jensen, Jan Halborg, Martinez, Karen Laurence & Nygård, Jesper, 2014, I: Applied Physics Letters. 104, 20, 5 s., 203504.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    40. Udgivet

      Interface of the polarizable continuum model of solvation with semi-empirical methods in the GAMESS program

      Svendsen, C. S., Blædel, K. L., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PloS one. 8, 7, 6 s., e67725.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    41. Udgivet

      Intermolecular interactions in the condensed phase: Evaluation of semi-empirical quantum mechanical methods

      Christensen, A. S., Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg & Cui, Q., 2017, I: Journal of Chemical Physics. 147, 16, 8 s., 161704.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    42. Udgivet

      Mapping enzymatic catalysis using the effective fragment molecular orbital method: towards all ab initio biochemistry

      Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, 11 s., e60602.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    43. Udgivet

      Molecular modeling basics

      Jensen, Jan Halborg, 2010, CRC Press. 175 s.

      Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt

    44. Udgivet

      PDB2PQR: Expanding and upgrading automated preparation of biomolecular structures for molecular simulations

      Dolinsky, T. J., Czodrowski, P., Li, H., Jensen, Jan Halborg, Nielsen, J., Klebe, G. & Baker, N. A., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, s. W522-W525

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    45. Udgivet

      PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

      Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    46. Udgivet

      PROPKA3: Consistent Treatment of Internal and Surface Residues in Empirical pKa Predictions

      Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R., Rostkowski, M. P. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 2, s. 525-537

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. Udgivet

      Predicting accurate absolute binding energies in aqueous solution: thermodynamic considerations for electronic structure methods

      Jensen, Jan Halborg, 2015, I: Physical chemistry chemical physics : PCCP. 17, 19, s. 12441-12451 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    48. Udgivet

      Predicting and rationalizing the effect of surface charge distribution and orientation on nanowire based bioFET sensors

      De Vico, L., Iversen, L., Sørensen, M. H., Brandbyge, M., Nygård, Jesper, Martinez, Karen Laurence & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Nanoscale. 3, 9, s. 3635-3640 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    49. Udgivet

      Predicting pKa for proteins using COSMO-RS

      Andersson, M. P., Jensen, Jan Halborg & Stipp, S. L. S., 2013, I: PeerJ. 1, 7 s., e198.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. Udgivet

      Prediction and rationalization of the pH-dependence of activity and stability of family 11 xylanases

      Kongsted, J., Ryde, U., Wydra, J. & Jensen, Jan Halborg, 2007, I: Biochemistry. 46, s. 13581-13592

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 1 2 Næste

    ID: 4057