Jan Halborg Jensen

Jan Halborg Jensen

Professor


  1. Udgivet

    Fast and accurate prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions

    Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg, Kruszyk, M., Jessing, M. & Jørgensen, M., 2018, I: Chemical Science. 9, 3, s. 660-665 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Fast and automated identification of reactions with low barriers using meta-MD simulations

    Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: PeerJ Physical Chemistry. 4, 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Fast and automated identification of reactions with low barriers: the decomposition of 3-hydroperoxypropanal

    Koerstz, M., Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: SciPost Chemistry. 1, 1, 34 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Fast and automatic estimation of transition state structures using tight binding quantum chemical calculations

    Rasmussen, Maria Harris & Jensen, Jan Halborg, 2020, I: PeerJ Physical Chemistry. 2, e15, 2.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    FragBuilder: an efficient Python library to setup quantum chemistry calculations on peptides models

    Christensen, A. S., Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PeerJ. 2, e277.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    FragIt: a tool to prepare input files for fragment based quantum chemical calculations

    Svendsen, C. S., Ibsen, M. W., Hansen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: PLoS ONE. 7, 9, 10 s., e44480.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Fully integrated effective fragment molecular orbital method

    Pruitt, S. R., Svendsen, C. S., Jensen, Jan Halborg & Gordon, M. S., 2013, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 9, 5, s. 2235-2249 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Genetic algorithm-based re-optimization of the Schrock catalyst for dinitrogen fixation

    Strandgaard, Magnus, Seumer, Julius Johannes, Benediktsson, B., Bhowmik, A., Vegge, T. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: PeerJ Physical Chemistry. 5, 17 s., e30.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Graphical analysis of pH-dependent properties of proteins predicted using PROPKA

    Rostkowski, M. P., Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: B M C Structural Biology. 11, 6

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    High throughput virtual screening of 230 billion molecular solar heat battery candidates

    Koerstz, M., Christensen, A. S., Mikkelsen, Kurt Valentin, Nielsen, Mogens Brøndsted & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 18 s., e16.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Hybrid RHF/MP2 geometry optimizations with the effective fragment molecular orbital method

    Christensen, A. S., Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2014, I: PloS one. 9, 2, 6 s., e88800.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Improved Treatment of Ligands and Coupling Effects in Empirical Calculation and Rationalization of pKa Values

    Søndergaard, C. R., Olsson, M. H. M., Rostkowski, M. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 7, s. 2284-2295 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Improving solvation energy predictions using the SMD solvation method and semiempirical electronic structure methods

    Kromann, J. C., Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 14 sep. 2018, I: Journal of Chemical Physics. 149, 10, 8 s., 104102 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Indium arsenide nanowire field-effect transistors for pH and biological sensing

    Upadhyay, S., Frederiksen, R. S., Lloret, N. D. C., De Vico, L., Krogstrup, Peter, Jensen, Jan Halborg, Martinez, Karen Laurence & Nygård, Jesper, 2014, I: Applied Physics Letters. 104, 20, 5 s., 203504.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Interface of the polarizable continuum model of solvation with semi-empirical methods in the GAMESS program

    Svendsen, C. S., Blædel, K. L., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PloS one. 8, 7, 6 s., e67725.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Intermolecular interactions in the condensed phase: Evaluation of semi-empirical quantum mechanical methods

    Christensen, A. S., Kromann, J. C., Jensen, Jan Halborg & Cui, Q., 2017, I: Journal of Chemical Physics. 147, 16, 8 s., 161704.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Mapping enzymatic catalysis using the effective fragment molecular orbital method: towards all ab initio biochemistry

    Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLOS ONE. 8, 4, 11 s., e60602.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Molecular modeling basics

    Jensen, Jan Halborg, 2010, CRC Press. 175 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    PDB2PQR: Expanding and upgrading automated preparation of biomolecular structures for molecular simulations

    Dolinsky, T. J., Czodrowski, P., Li, H., Jensen, Jan Halborg, Nielsen, J., Klebe, G. & Baker, N. A., 2007, I: Nucleic Acids Research. 35, s. W522-W525

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

    Boomsma, Wouter, Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, Kristoffer Enøe, Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, Jan Halborg, Lindorff-Larsen, Kresten, Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, Thomas Wim, 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    PROPKA3: Consistent Treatment of Internal and Surface Residues in Empirical pKa Predictions

    Olsson, M. H. M., Søndergaard, C. R., Rostkowski, M. P. & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 7, 2, s. 525-537

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Predicting accurate absolute binding energies in aqueous solution: thermodynamic considerations for electronic structure methods

    Jensen, Jan Halborg, 2015, I: Physical chemistry chemical physics : PCCP. 17, 19, s. 12441-12451 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Predicting and rationalizing the effect of surface charge distribution and orientation on nanowire based bioFET sensors

    De Vico, L., Iversen, L., Sørensen, M. H., Brandbyge, M., Nygård, Jesper, Martinez, Karen Laurence & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Nanoscale. 3, 9, s. 3635-3640 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Predicting pKa for proteins using COSMO-RS

    Andersson, M. P., Jensen, Jan Halborg & Stipp, S. L. S., 2013, I: PeerJ. 1, 7 s., e198.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Prediction and rationalization of the pH-dependence of activity and stability of family 11 xylanases

    Kongsted, J., Ryde, U., Wydra, J. & Jensen, Jan Halborg, 2007, I: Biochemistry. 46, s. 13581-13592

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 4057