Jan Halborg Jensen
Professor
- Udgivet
Prediction of pKa values for druglike molecules using semiempirical quantum chemical methods
Jensen, Jan Halborg, Swain, C. J. & Olsen, L., 2017, I: Journal of Physical Chemistry Part A: Molecules, Spectroscopy, Kinetics, Environment and General Theory. 121, 3, s. 699-707 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Prediction of pKa values using the PM6 semiempirical method
Kromann, J. C., Larsen, F., Moustafa, H. & Jensen, Jan Halborg, 2016, I: PeerJ. 4, 16 s., e2335.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
ProCS15: a DFT-based chemical shift predictor for backbone and Cβatoms in proteins
Larsen, A. S., Bratholm, L. A., Christensen, A. S., Channir, M. & Jensen, Jan Halborg, 2015, I: PeerJ. 3, 19 s., e1344.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein structure refinement using a quantum mechanics-based chemical shielding predictor
Bratholm, L. A. & Jensen, Jan Halborg, 2017, I: Chemical Science. 8, 3, s. 2061-2072 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Christensen, A. S., Linnet, T. E., Borg, M., Boomsma, Wouter, Lindorff-Larsen, Kresten, Hamelryck, Thomas Wim & Jensen, Jan Halborg, 2013, I: PLoS ONE. 8, 12, 10 s., e84123.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein – Protein Binding is Often Associated With Changes in Protonation State
Mason, A. C. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Proteins - Structure Function and Bioinformatics. 71, 1, s. 81-91Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying signal changes in nano-wire based biosensors
De Vico, L., Sørensen, M. H., Iversen, L., Rogers, D. M., Sørensen, B. S., Brandbyge, M., Nygård, Jesper, Martinez, Karen Laurence & Jensen, Jan Halborg, 2011, I: Nanoscale. 3, s. 706-717 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Random versus Systematic Errors in Reaction Enthalpies Computed Using Semiempirical and Minimal Basis Set Methods
Kromann, J. C., Welford, A., Christensen, A. S. & Jensen, Jan Halborg, 2018, I: ACS Omega. 3, 4, s. 4372-4377 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rationalization of the Difference in Lifetime of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates in Trypanosoma rangeli Sialidase
Parker, L. L., Chung, Y., Margulis, C. J. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Journal of Physical Chemistry B. 112, s. 14093-14095Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rationalization of the pKa values of alcohols and thiols using atomic charge descriptors and its application to the prediction of amino acid pKa's
Ugur, I., Marion, A., Parant, S., Jensen, Jan Halborg & Monard, G., 2014, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 54, 8, s. 2200-2213 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RegioML: predicting the regioselectivity of electrophilic aromatic substitution reactions using machine learning
Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2022, I: Digital Discovery. 1, 2, s. 108-114 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
RegioSQM20: improved prediction of the regioselectivity of electrophilic aromatic substitutions
Ree, Nicolai, Göller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 1 dec. 2021, I: Journal of Cheminformatics. 13, 1, 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Role of the virtual orbitals and HOMO-LUMO gap in mean-field approximations to the conductance of molecular junctions
Cehovin, A., Mera Couto, H., Jensen, Jan Halborg, Stokbro, K. & Pedersen, T. B., 2008, I: Physical Review B Condensed Matter. 77, 19Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Short strong hydrogen bonds in proteins: a case study of rhamnogalacturonan acetylesterase
Langkilde, Annette Eva, Kristensen, S. M., Lo Leggio, Leila, Mølgaard, A., Jensen, Jan Halborg, Houk, A. R., Poulsen, Jens-Christian Navarro, Larsen, Sine & Kauppinen, S., 2008, I: Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography. 64, s. 851-863Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Substituent Control of σ-Interference Effects in the Transmission of Saturated Molecules
Garner, M. H., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Solomon, Gemma C., 14 apr. 2022, I: ACS Physical Chemistry Au. 2, 4, s. 282-288 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sugar folding: A novel structural prediction tool for oligosaccharides and polysaccharides I
Xia, J., Daly, R. P., Chuang, F., Parker, L. L., Jensen, Jan Halborg & Margulis, C. J., 2007, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 3, s. 1620-1628Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sugar folding: A novel structural prediction tool for oligosaccharides and polysaccharides II
Xia, J., Daly, R. P., Chuang, F., Parker, L. L., Jensen, Jan Halborg & Margulis, C. J., 2007, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 3, s. 1629-1643Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Surface Reactions of Carbon Dioxide at the Adsorbed Water – Oxide Interface
Baltrusaitis, J., Schuttlefield, J. D., Zeitler, E., Jensen, Jan Halborg & Grassian, V. H., 2007, I: Journal of Physical Chemistry C. 111, s. 14870-14880Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Bicyclo[2.2.2]octane Motif: A Class of Saturated Group 14 Quantum Interference Based Single-Molecule Insulators
Garner, M. H., Koerstz, M., Jensen, Jan Halborg & Solomon, Gemma C., 2018, I: The Journal of Physical Chemistry Letters. 9, 24, s. 6941-6947 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Effective Fragment Molecular Orbital Method: A Merger of the Fragment Molecular Orbital and Effective Fragment Potential Methods
Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2010, I: Journal of Physical Chemistry A. 114, s. 8705-8712Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effective fragment molecular orbital method for fragments connected by covalent bonds
Svendsen, C. S., Fedorov, D. G. & Jensen, Jan Halborg, 2012, I: P L o S One. 7, 7, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The effective fragment potential: a general method for predicting intermolecular interactions
Gordon, M. S., Slipchenko, L., Li, H. & Jensen, Jan Halborg, 2007, Annual Reports in Computational Chemistry. Spellmeyer, D. C. & Wheeler, R. A. (red.). Elsevier, Bind 3. s. 177-193Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
The molecule calculator: a web application for fast quantum mechanics-based estimation of molecular properties
Jensen, Jan Halborg & Kromann, J. C., 2013, I: Journal of Chemical Education. 90, 8, s. 1093-1095 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toward De Novo Catalyst Discovery: Fast Identification of New Catalyst Candidates for Alcohol-Mediated Morita–Baylis–Hillman Reactions**
Rasmussen, Maria Harris, Seumer, Julius Johannes & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Angewandte Chemie - International Edition. 62, 49, 9 s., e202310580.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Towards a barrier height benchmark set for biologically relevant systems
Kromann, J. C., Christensen, A. S., Cui, Q. & Jensen, Jan Halborg, 2016, I: PeerJ. 4, 17 s., e1994.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uncertain of uncertainties? A comparison of uncertainty quantification metrics for chemical data sets
Rasmussen, Maria Harris, Duan, C., Kulik, H. J. & Jensen, Jan Halborg, 2023, I: Journal of Cheminformatics. 15, 1, 17 s., 121.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Using a genetic algorithm to find molecules with good docking scores
Steinmann, C. & Jensen, Jan Halborg, 2021, I: PeerJ Physical Chemistry. 3, 15 s., e18.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Very Fast Prediction and Rationalization of pKa Values for Protein-Ligand Complexes
Bas, D. C., Rogers, D. M. & Jensen, Jan Halborg, 2008, I: Proteins - Structure Function and Bioinformatics. 73, s. 765-783Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Virtual screening of norbornadiene-based molecular solar thermal energy storage systems using a genetic algorithm
Ree, Nicolai, Koerstz, M., Mikkelsen, Kurt Valentin & Jensen, Jan Halborg, 14 nov. 2021, I: Journal of Chemical Physics. 155, 18, 7 s., 184105.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
What the Heck?-Automated Regioselectivity Calculations of Palladium-Catalyzed Heck Reactions Using Quantum Chemistry
Ree, Nicolai, Goeller, A. H. & Jensen, Jan Halborg, 2 dec. 2022, I: ACS Omega. 7, 49, s. 45617–45623 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 4057
Flest downloads
-
2308
downloads
Protein structure validation and refinement using amide proton chemical shifts derived from quantum mechanics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1766
downloads
BioFET-SIM web interface: implementation and two applications
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1658
downloads
A computational method for the systematic screening of reaction barriers in enzymes: searching for Bacillus circulans xylanase mutants with greater activity towards a synthetic substrate
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet